En la Cuenta Pública 2016 del Ministerio de Defensa Nacional se informó que el Estado Mayor Conjunto implementó el nuevo sistema criptográfico interinstitucional, denominado EMCODOC, debido a la obsolescencia del antiguo sistema. El nuevo procedimiento reúne los requisitos para gestionar documentación e información de clasificación secreta a nivel interinstitucional. Paralelamente, se mantiene el entrenamiento en las coordinaciones de los diferentes puestos operativos del Centro de Operaciones de la Defensa, con el propósito de enfrentar de manera inmediata y eficiente cualquier situación de emergencia, catástrofe y crisis.
